查询助理工程师证书通常有以下几种方式：

网络查询

访问国家人力资源和社会保障部、国家职业资格网、中国人才网等官方网站进行在线查询。

在地方人力资源和社会保障局官网或在线查询平台输入证书编号进行查询。

窗口查询

直接前往当地人力资源和社会保障局进行窗口查询。

电话查询

拨打当地人力资源和社会保障局专业技术管理办的电话进行查询。

发函查询

通过用人单位向发证机关职称科发函核实证书的真实性。

第三方查询平台

利用第三方查询平台如启信宝、天眼查等进行查询。

微信查询

通过微信搜索相关公众号，如“国家安全生产考试”，进入证书查询页面进行查询。

请注意，不同地区的查询方式和时间可能存在差异，建议提前咨询当地的查询流程。同时，查询结果可能存在一定的滞后性，需要耐心等待或咨询相关机构