合同协议公证的流程一般包括以下几个步骤：

申请与受理

合同当事人向公证机关提出办理公证的申请，填写公证申请书，并提供相关的材料。公证机关会根据当事人的申请决定是否接受办理。

审查

公证机关（公证员）会对当事人进行询问，审查相关材料，并进行其他相关调查，以确认公证对象的真实性和合法性。

出具公证书

公证机关根据审查结果，如果认为申请提供的证明材料真实、合法、充分，且申请公证的事项真实、合法，则会在受理公证申请之日起十五个工作日内向当事人出具公证书。

在申请办理合同协议公证时，当事人应提交以下材料：

申请人的身份证明，法人资格证明及其法定代表人的身份证明。

需公证的合同（协议）文本若干份。

代理人代为申请的，提交当事人的授权委托书及代理人的身份证明。

申请公证的文书及相关证明材料。

此外，根据具体公证事项的不同，可能还需要提供其他相关的证明文件，例如财产证明、授权书、死亡证明等。

建议在办理合同协议公证时，提前准备好所有必要的材料，并咨询当地公证机关以获取详细的办理流程和所需材料，以确保公证过程顺利进行。