公积金提前扣款可能由以下几个原因造成：

缴存基数不足：

新入职员工可能因为入职时间晚或其他原因，导致当月实际工资较低，而公积金的缴存基数是根据工资计算的。如果当月工资不足以覆盖公积金的缴存比例，则第一个月公积金扣款可能会较多。

补缴原因：

如果员工之前没有在其他单位缴纳过公积金，或者之前缴纳的公积金没有及时转移，新入职的第一个月可能需要进行公积金的补缴，从而导致第一个月公积金扣款较多。

账户余额不足：

个人公积金账户里的余额可能不足以完全抵扣房贷扣款，系统会自动选择从银行卡进行扣款。

资金未转入还款账户：

用户公积金账户的资金如果没有转入到还款账户，也会导致无法从公积金账户扣款，可能需要从银行卡中扣款。

需要注意的是，公积金的扣款时间和工资发放时间是不一样的，单位每月需要为员工申报正确的五险一金缴费基数，以确保五险一金的正常缴纳。