在深圳出售房屋的个人所得税计算方式如下：

提供完整且准确的房屋原值凭证

如果纳税人（卖方）能在地税系统中查到房屋原值，或能提供房屋原值等费用发票，则个人所得税按照以下公式计算：

\[

\text{个人所得税} = （\text{计税价格} - \text{房屋原值} - \text{原契税} - \text{本次交易所缴纳税等合理费用}） \times 20\%

\]

未能提供完整且准确的房屋原值凭证

如果纳税人（卖方）不能在地税系统中查到房屋原值，也不能提供房屋原值等费用发票，则个人所得税按照以下公式计算：

\[

\text{个人所得税} = \text{计税价格} \times 1\%

\]

具体应用情况：

出售房屋不满2年：需缴纳1%个人所得税与5.6%营业税。

出售房屋（144㎡以下）满2年，不满5年：免缴5.6%营业税，只缴纳1%个人所得税。

出售房屋（144㎡以下）满5年，且出售方家庭除了出售房产以外，在本市没有其他居住用房：免缴1%个人所得税和5.6%营业税。

出售房屋（144㎡以下）满5年，且出售方家庭除了出售房产以外，有其他居住用房：缴纳1%个人所得税，5.6%营业税免缴。

出售房屋（144㎡以上，含144㎡）满2年而不满5年：营业税按照差额的5.6%征收，且需缴纳1%个人所得税。

出售房屋（144㎡以上，含144㎡）满5年，且出售方家庭除了出售房产以外，在本市没有其他居住用房：可免缴1%个人所得税，营业税则按照差额的5.6%征收。

建议：

纳税人在出售房屋时，应尽量提供完整的房屋原值凭证和相关费用发票，以便按照差额的20%税率计算个人所得税，从而减少税负。

如果无法提供完整凭证，则只能按照转让收入的1%核定应纳个人所得税额。